Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR4Q9NYA4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTMR4Q9NYA4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms