Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY99

SNTG2, Gamma-2-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG2Q9NY99 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTG2Q9NY99 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNTG2Q9NY99 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNTG2Q9NY99 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms