Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBA8Q9NY65 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBA8Q9NY65 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms