Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms