Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL11Q9NVR0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL11Q9NVR0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms