Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDP1Q9NUW8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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