Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMC4Q9NTJ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC4Q9NTJ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms