Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
A4GALTQ9NPC4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms