Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA8Q9NP80 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms