Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM60Q9H2L4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM60Q9H2L4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms