Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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