Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms