Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms