Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF1Q9BYJ9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms