Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC46A2Q9BY10 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms