Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL6Q9BWW8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL6Q9BWW8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms