Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms