Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf16Q9BUW7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms