Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP6Q9BRS8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP6Q9BRS8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms