Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
FYCO1Q9BQS8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
FYCO1Q9BQS8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms