Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms