Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM4BQ9BQ04 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RBM4BQ9BQ04 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms