Protein–RNA interactions for Protein: Q99643

SDHC, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHCQ99643 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHCQ99643 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHCQ99643 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHCQ99643 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHCQ99643 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHCQ99643 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHCQ99643 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHCQ99643 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHCQ99643 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHCQ99643 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHCQ99643 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms