Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MYCBPQ99417 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MYCBPQ99417 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MYCBPQ99417 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MYCBPQ99417 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MYCBPQ99417 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms