Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UHRF1Q96T88 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms