Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A9Q96Q91 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC4A9Q96Q91 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms