Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC85AQ96PX6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms