Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD4Q96M96 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD4Q96M96 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD4Q96M96 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms