Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SENP8Q96LD8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP8Q96LD8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms