Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms