Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPZA3Q96KX2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPZA3Q96KX2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms