Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGAP3Q96FM1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms