Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCC1Q96CN9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCC1Q96CN9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms