Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPTQ96BT3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPTQ96BT3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms