Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPSB1Q96BD6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPSB1Q96BD6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms