Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN23Q96B33 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN23Q96B33 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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