Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAVIN3Q969G5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms