Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC4Q92889 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC4Q92889 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC4Q92889 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC4Q92889 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC4Q92889 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERCC4Q92889 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERCC4Q92889 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERCC4Q92889 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERCC4Q92889 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC4Q92889 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC4Q92889 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms