Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CELF1Q92879 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CELF1Q92879 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CELF1Q92879 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CELF1Q92879 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CELF1Q92879 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CELF1Q92879 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CELF1Q92879 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CELF1Q92879 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CELF1Q92879 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms