Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRUQ92729 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRUQ92729 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms