Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PHF3Q92576 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PHF3Q92576 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms