Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBXN4Q92575 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN4Q92575 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms