Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY5

CREB3L4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L4Q8TEY5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L4Q8TEY5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L4Q8TEY5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms