Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACER1Q8TDN7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms