Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELQQ8TDG4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HELQQ8TDG4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELQQ8TDG4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms