Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVIPQ8NHG7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms