Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSNK2A3Q8NEV1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A3Q8NEV1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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