Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC191Q8NCU4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC191Q8NCU4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC191Q8NCU4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms