Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00301Q8NCQ3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms