Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms